Το ΚΕ.Μ.Ε.Ι.Ε.Δ.Ε. του Π.Τ.Δ.Ε. του Πανεπιστημίου Κρήτης (ίδρυση 2013) μελετά την ιστορία της ελληνικής εκπαίδευσης για τη βελτίωση της σύγχρονης παιδαγωγικής επιστήμης. Ψηφιοποιεί εκπαιδευτικά αρχεία και ιδιωτικές συλλογές (Συλλογή Ελένης Γλύκατζη Αρβελέρ). Διαθέτει πανεπιστημιακό  Μουσείο Εκπαίδευσης (ΜτΕ), συνδέοντας άρρηκτα την Κριτική Παιδαγωγική με την Τέχνη.

Το Κέντρο αναπτύσσει συνεργασίες με δημόσιους και ιδιωτικούς φορείς σε ευρωπαϊκό και διεθνές επίπεδο. Μέσα από τη διαχρονική εκπαιδευτική έρευνα και την επιμόρφωση εκπαιδευτικών, συνδέει την ιστορική κληρονομιά με σύγχρονες διδακτικές πρακτικές. Παράλληλα, ενισχύει την ιστορική αυτογνωσία και προωθεί μια βιώσιμη σχολική κουλτούρα παγκοσμίως. Τελεί υπό την αιγίδα της Περιφέρειας Κρήτης και του Δήμου Ρεθύμνης.